【摘 要】
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本文利用生物信息学方法搜索和统计了山羊和藏羚羊全基因组中完整型SSRs序列,并对其生物信息学特征进行比较分析.山羊和藏羚羊全基因组中SSRs总数量分别为920 300个和913 059
【机 构】
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重庆三峡学院生命科学与工程学院,四川大学生命科学学院
【基金项目】
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重庆市教委科学技术研究项目(No.KJ1401004);重庆市万州区科技计划项目(No.201403068);重庆市基础与前沿研究计划项目(cstc2015jcyjA80016)
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本文利用生物信息学方法搜索和统计了山羊和藏羚羊全基因组中完整型SSRs序列,并对其生物信息学特征进行比较分析.山羊和藏羚羊全基因组中SSRs总数量分别为920 300个和913 059个,占其全基因组长度的比例分别为5.56‰和5.39‰.山羊和藏羚羊全基因组SSRs六种重复类型的数量、比例、丰度和密度分布模式如下：单核苷酸SSRs〉二核苷酸SSRs〉三核苷酸SSRs〉五核苷酸SSRs〉四核苷酸SSRs〉六核苷酸SSRs,这六种重复类型SSRs特征相互比较有显著差异,而相同重复类型SSRs特征基本一致.山
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