创伤愈合及压力治疗过程中瘢痕动物模型转录组水平的变化研究

来源 :医用生物力学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:feboy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的利用RNA测序技术(RNA-seq)研究创伤愈合及压力治疗过程中巴马小型猪瘢痕动物模型转录组水平的变化。方法通过背部取皮建立巴马小型猪瘢痕模型,取皮第60 d开始加压(3.4 kPa)治疗,在取皮第0、14、30、60和90 d分别提取瘢痕组织总RNA进行测序。将所得序列映射到猪参考基因组并进行转录组重建,寻找差异表达基因(DEGs),利用生物信息学方法进一步对所得DEGs进行GO分析和KEGG通路富集性分析,同时挑选部分基因用qRT-PCR进行验证。结果测序数据经过预处理,各组均有78%以上的读段能准确比对到参考序列。DEGs鉴定结果表明,压力治疗前后有568个基因差异表达,其中上调289个,下调279个。GO富集分析发现,各组DEGs主要与细胞外基质、组织发展和皮肤发展相关。KEGG富集分析表明,创伤愈合过程中各组DEGs主要富集于细胞外基质-受体相互作用、黏着斑和凋亡通路;压力治疗前后的DEGs除了富集于以上通路,还富集于MAPK和PI3K信号通路。qRT-PCR检测表明,6个DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实RNA-seq结果的可靠性。结论 RNA-seq分析鉴定出创伤愈合及压力治疗过程中瘢痕动物模型的差异表达基因,为临床瘢痕的治疗研究提供实验依据。
其他文献
监狱企业的发展必须服务于"首要标准",以实现其价值功能为最终目标,这是最大的现实。应分析监狱企业发展,在职能上实现其经济型向改造型转变,在结构上实现复合型向单一型转变
目的:建立HPLC法检测大鼠氨茶碱血药浓度的方法,探讨左西替利嗪对大鼠茶碱血药浓度的影响。方法:设定2组,对照组为单用氨茶碱,观察组为左西替利嗪和氨茶碱同时灌胃给药,采用H
刑讯逼供等非法取证行为多发生在封闭性、秘密性较强的侦查程序中,因而往往难以证明和查实。如果不明确非法口供的证明对象、举证责任和证明标准,最终将导致排除规则形同虚设
目的:优化青蒿素固体脂质纳米粒(ART-SLN)的制备工艺。方法:采用溶剂乳化蒸发法制备ART-SLN。以投药量、大豆磷脂用量和表面活性剂浓度为考察因素,粒径和载药量为评价指标,根
目曲本文通过对22例经手术病理证实的非皮肤性恶性黑色素瘤病例的CT、MRI、乳腺钼靶影像作回顾性分析,结合文献,探讨其影像学表现。方法22例患者中作MRI平扫及增强扫描11侧,CT平
介绍了云南大姚6 1级地震多层砖砌体和钢筋砼框架结构房屋震害、不同烈度区的平均震害指数和震害预测计算,分析了震害原因,并与实际震害作了对比,总结了这次地震防御和减轻震
【正】 一、释义 八关斋,佛教在家信徒所持斋名,全称八关斋戒,又名八戒斋、八斋戒、八支斋,亦单名八斋。内容有八:(1)不杀生;(2)不贪盗;(3)不邪淫;(4)不妄语;(5)不饮酒;(6)不
[目的]利用CRISPR/Case9 HSF2基因敲除/激活质粒敲除/激活人结肠癌细胞株(HCT-116)中热休克转录因子 2(Heat Shock Transcription Factor 2,HSF2)的表达,构建出HSF2基因敲除
氢能是当今人类理想的清洁能源。在煤炭地下气化过程中 ,制氢原理包括H2 O (气态 )的分解、热解作用及CO的变换反应。实验室模型实验、煤炭地下气化半工业性试验及工业性试验
谷氨酰胺是一种条件性必需氨基酸,具有重要的生理作用,是一种极有开发前途的新药。本文对谷氨酰胺的生理作用、应用、生产及分离纯化工艺进行了综述。