用离散量预测拟南芥全基因组中内含子、外显子和基因间序列

来源 :内蒙古大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jjdoris1

【摘要】

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将拟南芥基因组全序列,按内含子、外显子及基因间序列区分为三类.在统计分析的基础上,选取21种三联体的概率,作为信号参数,并以这些参数分别构建内含子、外显子和基因间序列

【作者】

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陈翠霞李前忠王小龙

【机构】

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内蒙古大学理工学院物理系

【出处】

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内蒙古大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2004年4期

【关键词】

：

长度分布特征三联体离散量离散增量 length distribution characteristic trimer measure of diversi

【基金项目】

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国家自然科学基金

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将拟南芥基因组全序列,按内含子、外显子及基因间序列区分为三类.在统计分析的基础上,选取21种三联体的概率,作为信号参数,并以这些参数分别构建内含子、外显子和基因间序列的离散源,计算了离散量.某区间上任意一段序列的类型是由其离散量D(X)与同一区间上的三个标准离散量D(Xe)、D(Xi)和D(Xs)之间的离散增量的最小值决定的.由此实现了用离散量对三种核苷酸序列类型的预测,预测结果表明:标准集准确率达到84.26%,检验集达到84.64%.

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