全面预算管理作为军工科研单位里一种内部管理控制的方法，能够合理規划和控制军工科研单位的收入和支出，能够全面反映军工科研单位各项成本支出的使用情况，保证军工科研单位现有资源的有效利用，保证军工科研单位各科研项目的科研任务及其他业务的均衡发展和顺利实施。
　　军工科研单位在现阶段利用全面预算管理对内部控制、资源管理、成本管理等都发挥了一定作用，但军工科研单位的管理信息化手段仍处于落后状态。从预算的编制、审核、汇总、分析、预警等功能还仍旧依靠人力来完成，并且预算调整和预算外项目的申请均停留在纸介质审批状态。
　　因此，鉴于科研生产活动特点及军工科研单位管理活动现状以及信息化现状，建立“全面预算管理信息化系统”（能够支持军工科研单位核心业务形态的统一的数字化设计和管理信息化平台）势在必行。
　　全面预算管理信息化系统主要实现的目标包括：
　　1、 全所预算编制的数据在同一个预算模板下进行编制和汇总合并，杜绝模板引用混乱的状况；
　　2、 实现按时间、按部门、按业务内容、按类型等不同单元组织的数据汇总、合并与查询；
　　3、 实现预算编制、上报、审核、预算调整、预算控制的审批流程管理；
　　4、 实现实时监控功能和多级预警机制；
　　5、 通过饼图、柱状图、趋势折线图等多种形式展现分析数据。
　　从而使军工科研单位的全面预算管理更具时效性、准确性、灵活性，提升资金使用的统筹规划和资源的合理配置能力，强化预算执行和信息反馈，加强成本控制，实现资金收支平衡的精细化管理。
　　全面预算管理信息化需在军工科研单位整体战略规划目标的指导下，结合单位的发展战略，根据全面预算管理业务架构设计，形成军工科研单位的全面预算管理应用架构，实现从预算体系建立、预算编报、预算控制、预算分析与考核的信息化全过程管理，最终实现高稳定性、高及时性、高效率性、高易用性等技术指标。主要实施步骤为：
　　1、 全面预算管理范围确定
　　结合军工科研单位的实际情况，确定全面预算的组织范围和业务管理范围，明确汇总方式与汇总内容，以及预算管理信息化所覆盖的业务范畴。
　　2、 准备基础信息
　　由预算主责部门负责全面预算管理信息化实施中所需要的基础信息。
　　3、 整理预算管理样表
　　主要包括预算编号、编制要求、预算样表、预算样表间取数关系、计算公式等。
　　4、确定预算周期
　　确定全面预算的编制、审批、分析等的管理周期，一般分为月度、季度、年度，以此作为全面预算管理在时间维度上的关系与流程约束。
　　5、制定预算管理流程
　　根据全面预算管理制度，确定全面预算管理过程中的编制、调整等相关审批流程；同时确定预算审批流程中涉及到的每一个相关人员或岗位，并且界定相应的审核和批准权限。使预算审批工作实现在线审批、流程固化、流程可视化与追溯等功能。
　　6、抽取预算维度并建立预算模型
　　主要由预算主责部门与软件开发商共同商讨完成。
　　7、 确定业务系统控制关系
　　梳理需要集成的关键业务系统，确定集成原则和集成效果；在发生业务时，保证预算系统可以提供预算信息并进行预算检查，实现预警及执行控制功能。
　　8、取预算编制模块为试点
　　以预算编制模块为试点进行系统上线前期的考察，对预算编制的全过程进行跟踪，发现问题及时解决，为系统的正式上线打好基础。
　　9、取基础较好的单位进行试点
　　取基础条件较好并且是预算重点关注部门为测试部门进行系统上线前期的测试，从操作到应用进行全方面测试，为全面预算管理系统上线积累经验。
　　此外，全面预算管理系统需要与其他主要管理系统进行集成，全面预算作为军工科研单位资源合理分配以及执行控制的有力工具，为网上报销系统和合同管理系统提供预算控制信息；同时，集中核算系统、网上报销系统、合同管理系统也将预算执行情况及时的反馈至全面预算管理系统，提供预算执行分析数据。各个业务系统的集成，便于数据的引用、提取、分析，便于軍工科研单位的经营管理与决策。