泛素结合酶2S参与调控黑素瘤行为机制的生物信息学分析

来源 :中华皮肤科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:geniuscaobo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

揭示黑素瘤中可能与泛素结合酶2S(UBE2S)存在相互作用的基因,探讨UBE2S参与调控黑素瘤细胞生物学行为的分子机制。

方法

将A375黑素瘤细胞分为基因敲降组和阴性对照组,分别用含LV-UBE2S-RNAi(14011-1)的慢病毒和CON053慢病毒转染细胞构建UBE2S敲降细胞株和阴性对照细胞株。提取两组细胞株RNA,并将其纯化及片段化,与芯片探针杂交洗染获取芯片数据。采用Ingenuity路径分析软件对获得的差异表达基因的芯片数据进行进一步解析,鉴定可能与UBE2S存在相互作用的基因,应用免疫印迹法对UBE2S调控的下游分子进行验证。采用双尾t检验筛选差异基因。

结果

在基因敲降组与阴性对照组之间共筛选出差异倍数绝对值> 2且P < 0.05的差异基因512个,其中上调基因247个,下调基因265个。差异基因信息的Ingenuity路径分析结果证实,干扰素信号和肝X受体/视网膜X受体活化通路显著激活,真核起始因子2和核因子κB信号通路则被抑制。预测上游调控因子中IFNA2为强烈激活,核因子κB(复合物)被抑制。综合以上生物信息学分析结果,推测黑素瘤细胞UBE2S基因可通过调节IFITM1、STAT1、ISG15和TNFRSF11B基因的表达发挥功能。免疫印迹显示,A375细胞UBE2S基因敲降前后,IFITM1蛋白均未表达,敲降后ISG15蛋白表达上调19.94倍,STAT1蛋白表达上调1.47倍,TNFRSF11B蛋白表达下调79.1%。

结论

UBE2S可能通过与STAT1、ISG15和TNFRSF11B的相互作用,共同调控黑素瘤肿瘤细胞生物学行为。

其他文献
目的探讨甲状腺球蛋白(thyroglobulin, Tg)在甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer, PTC)131I治疗后侧颈淋巴结复发诊断中的作用及意义。方法回顾性分析2012年1月至2018年8月在天津医科大学肿瘤医院因侧颈淋巴结复发行手术治疗的PTC患者22例,所有患者首次手术后均行131I治疗。结果患者中位复发时间为30.5(5~86)月。22例患者首次手术后均
黑素瘤是高度恶性的免疫原性肿瘤,尽管以免疫检查点抑制剂为代表的免疫治疗可显著提高转移性黑素瘤患者的生存率,但仍有近半数患者对免疫治疗产生耐受和抵抗,且免疫相关不良反应发生率高。本文聚焦目前黑素瘤免疫治疗存在的耐受、抵抗及免疫相关不良反应等关键难点,总结相应的对策与研究进展。通过干预黑素瘤免疫抑制性微环境、筛选精准的生物标记物及优化免疫治疗联合策略等能够帮助解决免疫治疗耐受和抵抗的问题,同时传统免疫
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是肝脏最常见的原发性肿瘤,免疫疗法的诞生为晚期HCC患者治疗带来新的希望。在各种免疫治疗方法当中,程序性细胞死亡蛋白-1(programmed cell death- 1,PD-1)及其配体程序性死亡受体配体-1(programmed cell death-ligand 1,PD-L1)成为近期研究热点,PD-1/PD-L1信号通
期刊
目前研究发现,胃癌发生部位与其病理学特征及预后之间密切相关,并逐渐将近端胃癌和远端胃癌视作两种独立的肿瘤类型.本文简要概述近端胃癌和远端胃癌在病因学、病理学、基因
期刊
本综述介绍了自体肺移植在肺部疾病中心研究进展,总结了近十年国内外对自体肺移植的发展及其手术损伤的改进,分别从自体肺移植术式、临床适应症、术中关键点、术后并发症及其辅助治疗、预后效果等方面做出详细的总结描述,并为研究者提供有意义的参考,亟待基础和临床研究者进一步探究和评价自体肺移植的作用。
文化教学在对外汉语教学中必不可少,是帮助留学生进行汉语言学习的有效入口和媒介.本文从传统节日、汉字文化、中华礼仪、现代教育技术几个方面入手,浅谈对外汉语课堂上文化
本综述介绍了当前国内外对CD47在同种异体器官移植中的研究成果,着重从移植物缺血再灌注损伤中的作用和在移植免疫反应中的作用两个方面对不同信号通路的影响进行总结,以期为相
目的了解2017年至2019年肾综合征出血热患者的流行病学和临床特征。方法纳入2017年1月1日至2019年12月31日于安徽医科大学第一附属医院感染病科住院治疗的75例肾综合征出血热患者,回顾性分析患者的流行病学、临床症状、血常规、尿常规、血肌酐、肝功能等实验室检查指标。呈偏态分布的计量资料以M(QR)表示,比较采用非参数检验。采用多因素logistic回归分析疾病相关危险因素。结果75例患者起
回顾2例长期存活的胰肾联合移植受者并发胰瘘的临床诊治过程,归纳整理其治疗前后的实验室检查数据、影像学资料、治疗方式及预后转归,结合相关文献学习,研究分析后发现,移植肾功
目的研究乳腺特异性伽马成像(BSGI)的显像靶与非靶摄取比值(T/N值)与乳腺癌临床基本特征之间的关系,并探讨T/N值与乳腺癌预后的关系。方法收集2014年1月至2018年11月于复旦大学附属中山医院术前行BSGI检查的419例乳腺癌患者,分析T/N值与乳腺癌临床基本特征以及预后之间的关系。结果术后中位随访时间为34个月,43例复发,376例未复发。术前颅尾(CC)位和内侧斜(MLO)位的平均T/