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采用AFLP、RAPD和线粒体细胞色素b基因（Cytb）片段序列分析技术对半滑舌鳎（Cynoglossussemilaevis）群体遗传变异进行研究。分别采用5对选择性引物和18条随机引物对半滑舌鳎3个群体（黄海野生群体、渤海野生群体、养殖群体）进行分析。AFLP和RAPD分析结果表明，黄海群体的遗传多样性高于渤海群体，养殖群体的遗传多样性最低。利用Shannon多样性指数和基因分化系数进行遗传变异来源估算，结果表明，遗传变异主要来自于群体内。同其他鱼类相比，半滑舌鳎群体遗传多样性水平较低。对黄海、渤海野