【摘 要】
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为筛选SOCS6基因启动子区域单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)并研究其对启动子功能元件的影响,选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建DNA池,
【机 构】
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遵义师范学院生命科学学院,贵州大学动物科学学院,贵州省务川仡佬族苗族自治县饲草饲料站
【基金项目】
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贵州省科技厅联合基金项目(黔科合J字LKZS[2012]19号),遵义市科技局项目(遵市科合社字[2010]09号)
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为筛选SOCS6基因启动子区域单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)并研究其对启动子功能元件的影响,选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明,SOCS6基因5′调控区存在4个SNP位点,分别为T-513G、C-401T、A-332G和T-180G。生物信息学软件预测得到SOCS6基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近部分转录因子结合位点消失和新位点产生。多态性位点对转录因子结合位点有显著影响,但并不改
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