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分子遗传标记是随着分子生物学技术的飞速发展而出现的遗传学标记技术，它突破了以往形态标记、细胞学标记和蛋白质标记等表达型标记的局限性，因其所具有的高效性和可靠性而广泛应用于物种的遗传变异性研究领域。本文对限制性片段长度多态性（RFLP）、随机扩增多态DNA（RAPD）、微卫星DNA（SSR）以及线粒体DNA（mtDNA）序列多态性等常用的分子标记技术在海龟遗传多样性、繁殖生物学、种质资源鉴定和亲缘地理学以及进化研究中的应用作了简单介绍。