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区域创新悖论指的是，落后区域加速创新的需求，与其相对于发达地区吸引创新所需公共资金能力较低之间的矛盾。这一悖论本质的经验分析表明产业、高校和政府彼此之间从事R＆D存在强烈的互补性，而技术／创新政策和产业政策却向着相反的方向运行着。本文认为解决这一悖论需要首先从体系的需求和供给两个方面同时增强区域创新能力以增加创新活动中私人和公共部门的投资；同时在支柱产业应鼓励创新活动支出以协调技术政策和产业政策。