基于生物信息学的宫颈癌枢纽基因筛选及其与预后的关系

来源 :贵州医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fmf001

【摘要】

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目的:运用生物信息学方法筛选宫颈癌(CC)枢纽基因,并挖掘CC预后分析的潜在分子标志。方法:选取基因表达数据库(GEO)中CC表达数据集,利用R语言中的软件包筛选CC组织与正常宫颈

【作者】

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许修颖龚荣府杨娉娉方文

【机构】

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贵州医科大学医学检验学院生化教研室

【出处】

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贵州医科大学学报

【发表日期】

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2020年12期

【关键词】

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宫颈肿瘤计算生物学预后差异表达基因枢纽基因 KEGG通路 cervical cancer(CC) computational biology progn

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(81560481)

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目的:运用生物信息学方法筛选宫颈癌(CC)枢纽基因,并挖掘CC预后分析的潜在分子标志。方法:选取基因表达数据库(GEO)中CC表达数据集,利用R语言中的软件包筛选CC组织与正常宫颈组织中存在的差异表达基因(DEGs);并进行基因本体(GO)分析、基因组百科全书(KEGG)通路分析、蛋白质相互作用(PPI)网络构建、Cytoscape软件寻找枢纽基因、The Kaplan Meier plotter网站绘制枢纽基因生存曲线图,采用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库的UALCAN在线数据库验证CC患者枢纽基因的

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