基于生物信息学方法预测hsa-miR-181a在脑卒中发病中的分子调控网络

来源 :细胞与分子免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:owenyhz
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的运用生物信息学方法预测固有免疫信号分子hsa-miR-181a与脑卒中相关的分子调控网络。方法运用UCSC基因组浏览器、人类miRNA疾病数据库、TF-miRNA调控数据库、miRNA靶基因预测验证数据库、Genecards数据库、长链非编码RNA(LncRNA)疾病数据库、DLANALAB-Lnc Base数据库、转录因子结合谱数据库,研究hsa-miR-181a的上游转录因子,下游靶基因及与其相互作用的LncRNA间的多个调控途径,绘制hsa-miR-181a的核心调控网络图。采用脂多糖(LPS)刺激慢病毒感染的BV2小胶质细胞,采用实时定量PCR检测Toll样受体4(TLR4)、肿瘤蛋白63(p63)、miR-181a和核因子κB p65(NF-κB p65)的水平变化,对hsa-miR-181a调控网络进行验证。结果 UCSC数据库中显示hsa-miR-181a有2个亚型,在多个物种中具有高度保守性。通过疾病分析及文献调研发现hsa-miR-181a与多种疾病密切相关,尤其是缺血性疾病。信息学分析显示hsa-miR-181a受转录因子p63调控的同时,又调控着下游靶基因,脑源性神经营养因子(BDNF)、TLR4等58个基因。此外,Lnc RNA CDKN2B-AS1的转录和其锌指转录因子Snail、n-MYC也可能与hsa-miR-181a存在相互作用。所有基因构成一个以hsa-miR-181a为核心的调控网络,在脑卒中的发生与发展中起着重要作用。在LPS刺激的BV2细胞中,TLR4、p63、miR-181a水平升高,而RNA慢病毒技术干扰小胶质细胞中的p63的表达后,p63表达降低,miR-181a水平也降低,下游NF-κB p65水平被抑制,表明p63是TLR4调节miR-181a表达的关键信号分子。结论生物信息学方法预测并初步验证了hsa-miR-181a分子在脑卒中疾病中的调控网络,为深入研究提供了理论支持。
其他文献
为有效解决教育资源配置不均衡,邛崃市推行县管校聘改革。编制实行总量控制,采用按岗核编原则拟订学校教职工编制以及领导职数、专任教师数和教辅数。同时,教师实行三级竞聘、合
目的调查HIV/AIDS患者中巨细胞病毒(CMV)感染情况,比较血抗-CMV-IgM、血或尿CMV DNA载量等实验室指标以判断CMV感染的阳性检出率。方法采用化学发光免疫分析法(CLIA)和荧光定
机构编制是党的重要执政资源。当前,严控机构编制与满足发展需要之间的矛盾日益突出。为此,必须以习近平新时代中国特色社会主义思想为指引,大胆改革探索,推进编制挖潜增效和创新
在中职英语教学实践中,提高学生的英语职业能力一直都是教育的主要目标,但是传统的中职英语课堂教学形式并不利于学生学习。英语核心素养在中职英语课堂教学中的渗透,对于提
近年来,我国一些地方遭遇了严重雾霾天气,影响了人民群众的身体健康和社会生活的正常运转,治理雾霾也成为社会各界关注的焦点,考验着政府生态文明建设和贯彻绿色发展理念的能力。
2018年以来,广东省佛山市深化放管服改革,出台进一步深化商事制度改革优化营商环境的若干意见,通过再造企业开办全流程、统一服务和数据共享,实现企业开办时间从原来的19天压
和以往任何时代相比,我们所处的21世纪,在生产、生活的方方面面都发生了很大的变化,其中,社会对个体的影响力与日俱增。党的十八大以来,以习近平同志为核心的党中央统筹推进
目的:观察健脾消癌方对结肠癌SW620细胞中转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)/长链非编码RNA-ATB(long noncoding RNA ATB,lncRNA-ATB)/微小RNA 200a(mi