猪流行性腹泻病毒AH-2018-HF1株全基因组序列测定与分析

来源 :西北农林科技大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:songyinming
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[目的]对猪流行性腹泻病毒安徽毒株AH-2018-HF1进行全基因组测序,了解该毒株的分子生物学特征和遗传进化情况,为PEDV的进化和变异研究提供参考。[方法]从PEDV阳性病料(肠道组织)中提取RNA,反转录获得cDNA。将PEDV基因分为9段,设计相应的引物,采用分段重叠法对PEDV基因组进行分段扩增,扩增产物经克隆测序后,采用DNAstar软件拼接,获得全基因组,将此全基因序列与GenBank上公布的国内外25株PEDV毒株进行比对和分析。[结果]PCR扩增获得了4036,3724,2874,360
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