【摘 要】
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从菲律宾蛤仔黏附污泥中分离到1株絮凝率高达80.0％的高絮凝活性菌株JP,结合其序列比对和生理生化指标结果,菌株JP被鉴定为Pseudoalteromonas undina.通过Illumina测序平台对菌
【机 构】
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浙江海洋大学海洋科学与技术学院,浙江舟山 316022
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从菲律宾蛤仔黏附污泥中分离到1株絮凝率高达80.0％的高絮凝活性菌株JP,结合其序列比对和生理生化指标结果,菌株JP被鉴定为Pseudoalteromonas undina.通过Illumina测序平台对菌株JP进行基因组框架序列扫描测序,获得20个总长度为4046116 bp的框架序列,在这些框架序列中共预测到14个rRNA、87个tRNA和3746个基因,注释结果表明其主要参与肽聚糖、脂多糖、氨基糖、核苷酸糖、淀粉、蔗糖、果糖、甘露糖的生物代谢.产胞外多糖类絮凝剂代谢途径中关键前体、重复寡糖单元和调控基因均有发现,虽未找到eps基因簇,推测其可能具有与eps基因簇相似的基因承担对应的功能.
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