变长度Motif识别中的Gibbs抽样算法（英文）

来源 :生物数学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lxxfeng

【摘要】

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Motif识别是计算生物学中的重要问题.处理缺失数据的方法被大家广泛应用于生物序列中的Motif识别,例如EM算法,Gibbs抽样等等.现在识别Motif的方法都是首先假定Motif的长度是

【作者】

：

陈晓林汪四水

【机构】

：

中国科学院数学与系统科学研究院,苏州大学数学科学学院

【出处】

：

生物数学学报

【发表日期】

：

2010年3期

【关键词】

：

GIBBS抽样 MOTIF 变长度 Gibbs sampling Motif Variable length

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Motif识别是计算生物学中的重要问题.处理缺失数据的方法被大家广泛应用于生物序列中的Motif识别,例如EM算法,Gibbs抽样等等.现在识别Motif的方法都是首先假定Motif的长度是给的,但是,事实上Motif的长度是未知的,在这篇文章中,我们用Gibbs抽样算法在寻找Motif的位置的同时确定Motif的长度.

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