【摘 要】
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目的 利用ITS2(Internal Transcribed Spacer 2)序列及其二级结构对传统中药连钱草与其地方习用品及易混品进行分类鉴定.方法 提取连钱草药材基原植物活血丹基因组DNA,扩增ITS序列并测序;同时从GenBank数据库中下载活血丹等共8个物种42条ITS序列,基于隐马尔可夫模型注释到ITS2序列.运用MEGA7软件进行种内种间序列差异分析,并构建Neighbor-jioning(NJ)进化树.同时利用ITS2 Database预测各样本ITS2二级结构,并利用4Sale软件比对一
【机 构】
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西安医学院药学院,陕西西安710021
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目的 利用ITS2(Internal Transcribed Spacer 2)序列及其二级结构对传统中药连钱草与其地方习用品及易混品进行分类鉴定.方法 提取连钱草药材基原植物活血丹基因组DNA,扩增ITS序列并测序;同时从GenBank数据库中下载活血丹等共8个物种42条ITS序列,基于隐马尔可夫模型注释到ITS2序列.运用MEGA7软件进行种内种间序列差异分析,并构建Neighbor-jioning(NJ)进化树.同时利用ITS2 Database预测各样本ITS2二级结构,并利用4Sale软件比对一级结构和二级结构的联合矩阵,最终采用ProfDistS软件基于距离法构建Profile neighbor joining(PNJ)进化树.结果 各物种种内最大遗传距离远小于种间最小遗传距离,Barcoding Gap存在于活血丹与各易混品之间;各物种的二级结构均存在差异;系统发育树显示各样本均独立分支.结论 ITS2可以作为准确鉴别中药连钱草与其地方习用品及易混品的DNA条形码,为连钱草的基原鉴别及安全用药提供了科学依据.
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