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根据双机容错系统故障检测和诊断、仲裁技术的常用方案及特点，结合某在研双机容错系统，提出了一种基于FPGA容错控制器的设计方案。仲裁模块作为容错控制器的核心模块，可根据双机工作的监测信号负责完成主备机切换功能。为了实现软硬件心跳故障监控功能，在FPGA内嵌了WTD模块。同时，全局时钟引用于各个模块后，良好消除了输出信号的毛刺问题。实验结果表明，该设计方案满足系统要求，可靠性较好。