基于GEO数据库的DPN相关靶点挖掘及与芍药苷分子对接研究

来源 :广东药科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zcxwlh

【摘要】

：

目的基于GEO数据库挖掘与糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)发生发展相关的潜在基因与靶点,并通过分子对接探讨芍药苷的干预作用。方法从GEO数据库中

【作者】

：

陈佳李伟刘征江雅琴邢琪昌

【机构】

：

湘潭市中心医院药学部

【出处】

：

广东药科大学学报

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

基因表达综合数据库糖尿病周围神经病变靶点芍药苷分子对接 Gene Expression OmnibusDPNtargetspaeoniflorinmol

【基金项目】

：

湖南省中医药管理局科研计划项目(201999)

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目的基于GEO数据库挖掘与糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)发生发展相关的潜在基因与靶点,并通过分子对接探讨芍药苷的干预作用。方法从GEO数据库中收集DPN和糖尿病人群研究的全基因组微阵列共计12例。在GEO2R平台内对两组的数据做差异基因分析,将筛选出的差异基因导入STRING在线数据库,获得差异基因所编码的蛋白质之间的相互作用并分析筛选核心靶点。采用AutoDock VINA对芍药苷与上述筛选的核心靶点进行对接打分,并采用Western blot

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