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目的了解深圳地区中小学生乙型肝炎病毒(HBV)感染现状及基因型分布情况,为HBV患者合理用药提供依据。方法选取2016年3月～2017年9月在深圳地区就读的中小学生4217名,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测学生血清中HBV表面抗原(HBVHBsAg),对HBsAg为阳性的学生,采用PCR法检测HBVDNA,对HBVDNA阳性标本采用PCR测序法对HBV基因型进行分析,并对结果进行统计分析。结果 4217名中小学HBV-HBsAgELISA法阳性率为6.28%(265/4217),其中男生为6.69%(137/2047),女生为5.90%(128/2170),男生略高于女生,但差异无统计学意义(χ~2=1.492,P>0.05),经PCR-DNA定量复检阳性230例,阳性符合率为86.79%(230/265),其中初中生阳性率为5.62%(124/2206),小学生为5.27%(106/2011),两者差异无统计学意义(χ~2=0.835,P>0.05)。HBVDNA阳性标本中B基因型检出率为61.30%(141/230),明显高于C基因型的24.35%(56/230),差异有统计学意义(χ~2=6.755,P<0.05),混合感染以B+C为主,感染率为12.17%(28/230);初中生和小学生HBV各基因型分布之间差异均无统计学意义(χ~2=0.573～1.132,P>0.05),男生和女生之间差异也均无统计学意义(χ~2=0.759～1.496,P>0.05)。结论深圳地区中小学生有一定的HBV感染率,B基因型为本区HBV感染的主要基因型,其次为C基因型,混合感染以B+C混合基因型为主。因此,加强HBV基因型分析对HBV合理用药具有重要的意义。