甘蓝型油菜ZIP基因家族全基因组鉴定与表达分析

来源 :中国油料作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：tianshu888

【摘要】

：

ZIP基因家族是重要的转运蛋白类基因家族,主要参与金属阳离子的吸收和转运,在植物生长发育和重金属胁迫响应中发挥重要作用。为解析甘蓝型油菜中ZIP基因家族,采用生物信息学方法在甘蓝型油菜中鉴定到51个ZIP基因家族成员,对比芸薹属三个基本种发现ZIP基因家族在A、C亚基因组上有串联重复现象。以甘蓝型油菜品种中双11(ZS11)全基因组为参考基因组,将ZIP基因家族定位到17条染色体上,预测到10种Motif基序,均包含ZIP结构域,并对ZIP基因家族上游3 kb的启动子区域进行了顺式作用元件测序。通过系统进

【作者】

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贺丹杨太桦黎婷吴金锋彭佳师刘丽莉张大为严明理李再云

【机构】

：

湖南科技大学生命科学学院,经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室,作物遗传改良国家重点实验室,农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室

【出处】

：

中国油料作物学报

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

甘蓝型油菜 ZIP基因家族镉处理全基因组分析

【基金项目】

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国家重点研发计划(2018YFD1000904),国家自然科学基金(32071965,U19A2029),农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室开放课题(KF2020011)。

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