【摘 要】
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为了研究MYB基因在茭白植株生长发育中的作用及相关功能。本研究基于茭白基因组和茭白孕茭前后的转录组数据,利用生物信息学软件对ZlMYB家族成员进行鉴定,分析其在茭白孕茭前后的表达模式。生物信息学分析主要包括家族成员蛋白理化性质分析、保守基序、系统发育树、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件分析等。结果表明在茭白基因组中共筛选到188个ZlMYBs基因,氨基酸长度在237~2 814 bp 之间,均为
【基金项目】
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安徽省重点研究和开发计划项目(201904a06020057)资助;
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为了研究MYB基因在茭白植株生长发育中的作用及相关功能。本研究基于茭白基因组和茭白孕茭前后的转录组数据,利用生物信息学软件对ZlMYB家族成员进行鉴定,分析其在茭白孕茭前后的表达模式。生物信息学分析主要包括家族成员蛋白理化性质分析、保守基序、系统发育树、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件分析等。结果表明在茭白基因组中共筛选到188个ZlMYBs基因,氨基酸长度在237~2 814 bp 之间,均为亲水性蛋白,其中170个基因定位于存在于细胞核中;顺式作用元件分析显示,MYB基因启动子区域含有多个激素响应、细胞分化及非生物胁迫相关作用元件和结合位点,表明茭白MYB基因家族可能参与了茭白的生长发育、激素调节和胁迫响应;表达量分析表明大多数MYB家族基因在茭白孕茭后转录水平发生变化,表明这些基因可能在茭白孕茭过程中发挥了作用。本研究为进一步研究茭白MYB转录因子的调控功能提供理论依据。
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