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目的分析云南省2008~2011年中国疾病监测信息报告系统(National Notifiable Disease Reporting System,NNDRS)乙型病毒性肝炎(乙肝)报告情况和质量,提出监测建议。方法对NNDRS报告的乙肝病例、云南省乙肝高发地区报告准确性的专项调查资料、云南省乙肝主动监测系统资料进行分析。结果云南省乙肝报告发病率呈逐年上升趋势,2006年发病率最高(51.94/10万),较1990年上升l.46倍,较实施网络直报前的2003年上升1.10倍:2006年后发病率上升趋于平缓;2007~2011年,云南省报告急性乙肝发病率逐渐下降。2007年保山市5所医疗机构乙肝病例报告准确率仅为4.05%,93.92%的报告病例是慢性乙肝病毒(Hepatitis B Virus,HBV)携带者。2008~2011年,在同期、同地点、同监测医院,由疾病预防控制中心复核NNDRS报告的乙肝病例,剔除慢性HBV携带者后,上报的乙肝平均发病率是17.36/10万,但NNDRS报告的乙肝平均发病率是46.04/10万,是云南省主动监测系统报告发病率的2.42倍。结论云南省乙肝报告发病率不准确,与慢性HBV携带者等不足于诊断为乙肝病例的就诊者被作为乙肝病例报告有关,NNDRS乙肝报告的发病率高于全省乙肝实际发病水平。