脱发相关差异表达基因的生物信息学分析

来源 :遗传 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ijlusr

【摘要】

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利用生物信息学方法分析脱发相关差异表达基因,有望帮助了解脱发发生发展的分子机制。本研究从NCBI的子数据库GEO中选择基因表达谱GSE45512和GSE45513数据集,利用R语言limma

【作者】

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向虹阳小胡艾亮霞潘燕平胡勇

【机构】

：

中国科学院深圳先进技术研究院合成生物研究所

【出处】

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遗传

【发表日期】

：

2020年2期

【关键词】

：

脱发斑秃 GEO 生物信息学 hair lossalopecia areataGEObioinformatics

【基金项目】

：

深圳市科技创新委员会基础科学研究基金(编号:JCYJ20180507182250795),中国博士后科学基金(编号:2019M663173),深圳孔雀团队项目(编号:KQTD20170331160605510)资助

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利用生物信息学方法分析脱发相关差异表达基因,有望帮助了解脱发发生发展的分子机制。本研究从NCBI的子数据库GEO中选择基因表达谱GSE45512和GSE45513数据集,利用R语言limma工具包,筛选出两个物种斑秃样本与正常样本的共同显著差异表达基因。对这部分基因进行功能注释和蛋白互作网络分析,同时对全部差异表达基因进行基因集富集分析。结果发现,人头皮斑秃样本共筛选出225个差异表达基因;C3H/HeJ小鼠自发斑秃皮肤样本共筛选出337个差异表达基因;两个物种的共同显著差异表达基因有23个。GO功能富集

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