茶树EST-SSR的信息分析与标记建立

来源 :茶叶科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yanqingqing1213

【摘要】

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在1589条茶树EST中，共发掘出了281个EST-SSR，分布于246条EST中，出现频率是17．68％，平均长度为33．06bp，平均分布频率是1，2．61kb。在茶树EST-SSR中，二核苷酸重复是主要的重复类型，出现最多的

【作者】

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金基强崔海瑞陈文岳卢美贞姚艳玲忻雅龚晓春

【机构】

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浙江大学原子核农业科学研究所,杭州市农业科学院

【出处】

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茶叶科学

【发表日期】

：

2006年1期

【关键词】

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茶树 EST SSR信息标记建立 tea plant ESTs SSR information marker development

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在1589条茶树EST中，共发掘出了281个EST-SSR，分布于246条EST中，出现频率是17．68％，平均长度为33．06bp，平均分布频率是1，2．61kb。在茶树EST-SSR中，二核苷酸重复是主要的重复类型，出现最多的重复基元类型是AG／CT重复。设计了19对SSR引物，在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后，建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板，对引物进行了筛选，有16对引物显示扩增，可用率为84．2％；进一步在10个茶树品种

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