【摘 要】
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耐碳青霉烯类抗生素的超级细菌给人类健康带来了严重威胁,其所携带的金属β-内酰胺酶编码基因是耐药性的主要来源.NDM-1作为其中传播最广、活性最强的β-内酰胺酶,其抑制剂的研发刻不容缓.具有广谱作用的抗菌肽thanatin对NDM-1展现出了较好的抑制效果,但抑制机理并不清楚.本文使用HPEPDOCK与Rosetta FlexPepDock服务器,将thanatin与NDM-1进行了分子对接,并使用Desmond软件包对对接模型进行了分子动力学模拟.结果 表明,thanatin与NDM-1活性中心的Zn2+
【机 构】
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沈阳化工大学化学工程学院 沈阳110020;陆军军医大学大坪医院生殖医学中心 重庆400042;陆军军医大学全军免疫学研究所 重庆400038
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耐碳青霉烯类抗生素的超级细菌给人类健康带来了严重威胁,其所携带的金属β-内酰胺酶编码基因是耐药性的主要来源.NDM-1作为其中传播最广、活性最强的β-内酰胺酶,其抑制剂的研发刻不容缓.具有广谱作用的抗菌肽thanatin对NDM-1展现出了较好的抑制效果,但抑制机理并不清楚.本文使用HPEPDOCK与Rosetta FlexPepDock服务器,将thanatin与NDM-1进行了分子对接,并使用Desmond软件包对对接模型进行了分子动力学模拟.结果 表明,thanatin与NDM-1活性中心的Zn2+并无直接相互作用,而是作为竞争性抑制剂结合于NDM-1的活性口袋,阻止抗生素分子进入活性口袋与Zn2+结合,从而抑制NDM-1的水解活性.本文为研发有效的NDM临床抑制剂探索了可行的方法.
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