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对茶花变异种及原种进行ISSR分析,所选用的100个引物中有12个产生了较为清晰有效、重复性好的条带。12个引物共扩增出110条带,其中8个引物可扩增出多态性条带,多态位点百分率为11.8%。聚类分析表明,粉丹变异而来的金银丹与原种粉丹的遗传距离较小,由早春大红球变异而来的花早春与原种早春大红球的遗传距离较小,而粉丹和早春大红球2个种之间则差异较大。