目前我国及世界公认有效的乙肝抗病毒药物，包括干扰素和核苷类似物两大类，它们分别是普通干扰素α、聚乙二醇化干扰素α、拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦和替比夫定等。核苷类似物包括拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦，其优点是口服用药方便，适用范围广，除用于慢性乙肝外，还可以用于重型肝炎和活动性肝硬化病人，而这两类患者是不能用干扰素的。干扰素的优势在于可以用于儿童乙肝患者，疗程相对较短，治疗一旦获得应答，维持时间较长，复发率较小。
　　从抗病毒治疗的长期性、有效性和安伞性综合考虑，一般推荐首选聚乙二醇化干扰素α、阿德福韦酯和恩替卡韦，主要原因是这几种抗病毒药物疗效较好，可以长期使用，用药期间和用药之后发生病毒变异耐药的现象较少。次选普通干扰素α、拉米夫定、替比夫定，主要原因是普通干扰素α疗效不如聚乙二醇化干扰素α，而且普通干扰素α治疗亚裔人种乙肝患者疗效较差。如果选用普通干扰素α治疗亚裔乙肝患者，有效应答率只有20％左右；而使用聚乙二醇化干扰素α，有效应答率可以提高到50％左右。拉米夫定和替比夫定具有较高的病毒变异率。服用拉米夫定第一年的病毒变异率为14％，第四年则为66％；替比夫定的病毒变异率小于拉米夫定，但仍然高于阿德福韦酯和恩替卡韦。
　　聚乙二醇化干扰素α、阿德福韦酯和恩替卡韦有无差别呢?一般来说，聚乙二醇化干扰素α疗程相对短一些，一般为6～12个月，适应于年龄较小的患者，如儿童、少年、青年；尤其是对于想要结婚生育者，比较容易接受。但聚乙二醇化干扰素α不适应于肝硬化患者，也不能用于出现黄疸的患者；而且价格偏贵，用药期间会出现一过性骨髓抑制及类感冒等不良反应。阿德福韦酯和恩替卡韦主要用于成年人乙肝患者，使用起来相对安全，治疗过程中没有明显不适，抑制病毒速度较快，治疗一年后乙肝病毒DNA阴转可以达到60％以上，但出现乙肝病毒e抗原与e抗体血清学转换的概率只有20％左右。临床认为，使用这两种药物的治疗终点，必须看到乙肝病毒e抗原与e抗体的血清学转换；对于乙肝病毒e抗原阴性的患者，治疗的终点是乙肝病毒表面抗原转阴。这样治疗的时间就比较长。阿德福韦酯和恩替卡韦使用期间出现病毒变异耐药的情况，要好于拉米夫定和替比夫定。阿德福韦酯使用2年后，出现病毒变异耐药的概率为3％左右，恩替卡韦小于1％。这是它们的优势所在。极少数使用阿德福韦酯的患者会出现肾功能损害，此时必须换药。
　　由于每个病人情况不同，临床医生在制定治疗方案时，都会慎重权衡，进行个体化选择，不存在哪种药好哪种药不好的问题。使用干扰素抗病毒，要严格掌握适应症，严重肝硬化、癫痫、有精神病史、白细胞和血小板低、自身免疫性疾病等患者不能使用。用药中要密切监测血象、肝功能、病毒学指标及血糖、甲状腺功能，避免出现严重副作用。使用核苷类药物过程中，也要注意监测肝功能和病毒学指标。