【摘 要】
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胃癌组织中肿瘤相关成纤维细胞(carcinoma associated fibroblasts,CAFs)是胃癌微环境的重要成分,主要来源于正常成纤维细胞(normal fibroblasts,NFs)的活化,对胃癌的发生发
【机 构】
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地方病与少数民族疾病教育部重点实验室(贵州医科大学); 贵州医科大学分子生物学重点实验室; 襄阳市第一人民医院病理科; 贵州医科大学附属医院临检科;
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.31560326,31660031)资助;贵州省科技厅黔科合平台人才[2017]5652;贵州市科技局筑科合同[2017]5-16~~
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胃癌组织中肿瘤相关成纤维细胞(carcinoma associated fibroblasts,CAFs)是胃癌微环境的重要成分,主要来源于正常成纤维细胞(normal fibroblasts,NFs)的活化,对胃癌的发生发展有重要作用,但是两者之间的基因表达差异并不完全清楚。本研究选取从人胃癌组织中分离获得的CAFs及NFs各3组,进行转录组学研究,筛选出3组细胞中交集且差异倍数较大的基因12个,用Omicsbean在线工具对差异基因进行Gene Ontology(GO)功能及KEGG通路富集,构建蛋白质相互作用调控网络;最后用RT-qPCR验证CAFs和NFs中差异基因的表达。结果显示,筛选出的12个差异表达基因主要参与NF-κB信号、炎症、细胞黏附、细胞表面受体和细胞因子等功能,上述功能均与肿瘤的发生发展密切相关。RT-qPCR检测发现,与NFs相比,CAFs中BCL2A1、NKX3-2、CXCL12、TNFAIP3、FOS、CDH4及CLDN1表达上调;ATF3、CYFIP2、CCL11、KLF2及GDF15基因表达下调,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结果提示,胃癌CAFs与NFs中存在肿瘤相关的差异表达基因,这些差异基因可能在胃癌微环境中发挥重要作用。
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