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为了解我国猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异规律，应用连续 RT-PCR方法扩增分离的4株 PEDV 流行毒株的 S 基因，并对 S 基因进行测序、同源进化和 B 细胞抗原表位分析。结果显示，4个流行毒株 S 基因长4161（4158）个碱基，在59-62位（GENQ）和140（N）位的插入突变和163-164位（NI）缺失突变，属于与 CV777、DR13和 KPEDV-9等参考疫苗毒株不同的进化分支 G2群，与参考疫苗毒株之间的氨基酸同源性为92．4％～93．3％；B 细胞线性抗原表位分析显示，流行毒株52-62、360-365、752-781位抗原表位显著高于疫苗毒株，提示可能与流行毒株的致病性、受体结合能力和侵染性等相关。