一种新宏基因组DNA片段物种属性约简分类方法的研究

来源 :北华大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yalaso_wind

【摘要】

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由于宏基因组学的迅猛发展,导致可测序的宏基因组数量激增,可测DNA序列也在扩大,但绝大部分DNA序列种属未知,故生物信息学面临的重要课题是研究一种如何针对这些巨大量宏基因

【作者】

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薛健车长金

【机构】

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北华大学电气信息工程学院

【出处】

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北华大学学报：自然科学版

【发表日期】

：

2017年6期

【关键词】

：

宏基因组学粗糙集属性约简物种分类 metagenomics rough set attribute reduction species classific

【基金项目】

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吉林省科技发展计划项目(20170520057JH),吉林省教育厅科学技术研究项目(201656),吉林市科技创新技术项目(201414012).

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由于宏基因组学的迅猛发展,导致可测序的宏基因组数量激增,可测DNA序列也在扩大,但绝大部分DNA序列种属未知,故生物信息学面临的重要课题是研究一种如何针对这些巨大量宏基因组DNA信息属性约简并正确分类的方法.提出采用RandWPSO结合粗糙集的优化算法,分别对宏基因组中的DNA片段在不同属、同属不同种情况下进行属性约简并分类,经实验证明能够进行有效约简可取得较高的分辩准确率.

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