氨肽酶N（aminopeptidase N,APN）蛋白是猪（Sus scrofa）传染性胃肠炎病毒（Transmissible gastroenteritis virus,TGEV）和猪的流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）等一系列冠状病毒的受体蛋白。为探讨梅山猪APN基因的分子结构特征以及重要的变异位点,本研究通过PCR扩增和测序技术,结合生物信息学分析梅山猪APN基因功能区域和重要变异位点,对其蛋白质结构进行预测和分析。结果表明,梅山猪APN基因cDNA全长2 886 bp（GenBank登录号:KF280271）,含有20个外显子,编码961个氨基酸。与GenBank数据库公布的标准序列（登录号:NM₂14277.1）相比,梅山猪APN基因编码区变异共引起10处氨基酸突变与2处氨基酸缺失,其中Phe82Asn、Leu107Phe、Leu108 Ile、Ser330Pro、Trp399Arg和Glu465 Gly等6处突变位于APN酶催化活性区域,Gln747His突变、748Tyr和749Ser缺失突变位于APN病毒结合区域。蛋白结构和编码产物功能分析发现,pAPN为不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,具有1个跨膜螺旋(跨膜区位于12³4氨基酸,二级结构元件以α螺旋和β折叠为主,编码产物主要参与细胞被膜（cell envelope）、中央中间代谢（central intermediary metabolism）、辅酶因子生物合成（biosynthesis of cofactors）等功能。Gln747His、748Tyr和749Ser缺失突变可能与氨肽酶N结合病毒能力有关。本研究对梅山猪pAPN基因功能的分析及变异位点的筛选,为今后筛选猪抗病毒性腹泻的有效遗传标记提供理论基础。