伊尹制汤液而始有方剂，由此发展出的现代中药复方及其制剂以其在慢性多因素性疾病的良好治疗效果而备受关注，代表了未来新药发现的一个重要方向。中药复方具有特殊的或者被忽视的独特作用原理，这与单一成分作用的“神弹理论”有较大差别，也与现代多靶点药物的内涵不尽相同。“伊尹汤液理论（Yiyin decoction theory）”是基于现代科学技术方法描述和阐释这种具有超前意识的个性化组合用药的特殊药理效应机制，既考虑到疾病/证候的非稳定性，也注意到疾病在受到药理干扰时表现出来的顽固性和自适应性，以及疾病的多因素病因之间相互关联性，作者把其科学内涵概括为“复方配伍，多重效应，适度调治”。复方配伍涉及组成药物君臣佐使药之间复杂性相互作用。多重效应涉及多种常规的以及非常规的作用机制、非线性反馈相互作用的综合药理效应。适度调治则反映其最终可从整体上精准地实现对疾病生物网络的多点嵌套调控。要破解“伊尹汤液”之谜，并非仅仅简单研究已知活性物质（成分）及其在混合物中独立的靶点作用，更需要重新发现和认识中药复方的“暗物质”“暗效应”,即常规药理效应规律之外的、被忽视的非典型药理效应规律以及在生物体内发挥精准调控功能的多点嵌合机制。伊尹汤液理论聚焦中药复方的整体药理效应规律以体现其综合的临床价值，对于发展符合中医药理论的中药复方新药评价与转化应用新模式具有重要意义。