nifA突变的苜蓿根瘤菌在根瘤中的转录组学分析

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用全基因组微阵列比较了根瘤中苜蓿根瘤菌1021的nifA突变菌和野生菌的基因表达谱.分析结果表明,nifA的缺失引起601个基因的表达发生变化.这些基因分别属于生物大分子的合成代谢、三羧酸循环及呼吸代谢以及结瘤固氮过程等多个功能组,预示着根瘤中细菌的生长状态发生了显著的变化.在根瘤中,fixK以及受其激活的基因在nifA突变菌中的表达量显著高于野生菌.定量实时PCR分析表明,根瘤中fixLJ的转录水平在nifA突变菌中显著高于野生菌.通过统计学方法从13个表达发生显著变化的基因的上游调控序列中找到推测的NifA结合位点. Genomic microarrays were used to compare the gene expression profiles of nifA and wild strains of nodulated alfalfa nodules 1021. The results showed that the expression of 601 genes was changed by the deletion of nifA.These genes belong to the synthesis of biological macromolecules Metabolism, tricarboxylic acid cycle and respiratory metabolism, and nodulation and nitrogen fixation process and other functional groups, indicating that the growth of bacteria in nodules have undergone significant changes in the nodules, fixK and activated genes in nifA mutant Was significantly higher than that of wild-type bacteria.Quantitative real-time PCR analysis showed that the fixLJ transcription level in nodules was significantly higher than that of wild-type bacteria in nifA mutants.Statistical analysis showed that, Find the putative NifA binding site.
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