目的探索广东省社区医疗机构卫生应急相关科室设置和制度建设现状,为今后开展基层卫生应急管理提供科学依据。方法于2013年3—9月,采用分层随机抽样的方法在广东省21个地市抽取220家社区医疗机构(珠三角地区抽取110家,粤东粤西抽取80家,粤北地区抽取30家社区医疗机构)开展调查,调查内容包括卫生应急人力资源、科室设置和卫生应急制度情况。结果被调查的社区医疗机构中,每万居民拥有临床医生、护士和公卫医师数分别为(5.1±4.4)、(5.1±4.8)、(1.4±1.8)人,有193家(87.7%)社区医疗机构设置了传染病报告专职人员;设置应急指挥部门、应急处理小组、发热门诊和预检分诊处的社区医疗机构分别为135家(61.4%)、162家(73.6%)、209家(95.0%)和128家(58.2%);有195家(88.6%)社区医疗机构建立了应急管理制度,194家(88.2%)与上级部门建立了协作沟通机制;有174家(79.1%)社区医疗机构建立了卫生应急综合预案,其中专项预案的建立率排在前四位的是传染病疫情预案(93.6%)、食源性疾病爆发预案(62.7%)、医院性感染爆发预案(51.8%)和新发传染病/群体性不明原因传染病预案(50.9%),其中珠三角社区医疗机构的卫生应急科室设置和制度建设优于其他地区(P<0.05)。结论广东省社区医疗机构卫生应急相关科室设置及制度建设现状存在不足,应加强基层医疗机构卫生应急软硬件的建设,提高基层卫生应急水平。