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以陆地棉中棉所36为轮回亲本和海岛棉海1为供体亲本, 构建染色体片段代换系。为了能检测到稳定的株高QTL，将三个代换系群体（BC5F3, BC5F3：4和BC5F3：5）在5个环境中种植，2009年和2010年分别在河南安阳种植BC5F3单株、BC5F3：4株行， 2011年分别在河南安阳、辽宁辽阳和新疆石河子种植BC5F3：4株系。结果表明，在不同群体环境中株高的超亲比例为53.43%~88.97%。从早期构建的总图距为5088.28 cM， 含有2280个SSR标记位点，覆盖26条染色体的遗传连锁图谱