【摘 要】
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目的：利用生物信息学方法分析参与肾小管上皮细胞（HK-2）相关的候选基因及其潜在机制。方法：数据来源于NCBI的Gene Expression Omnibus数据库，下载编号为“GSE30122”、“GSE142153”的芯片数据。本研究使用R语言中GEO query包下载GEO芯片矩阵及临床信息，采用stringr、dplyr及limma等程序包对基因芯片数据进行质量分析。识别相关差异表达基因，
【基金项目】
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黑龙江省卫健委课题，编号：20211111000051； 黑龙江省自然科学基金联合引导项目，编号：LH2019H060；
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目的：利用生物信息学方法分析参与肾小管上皮细胞（HK-2）相关的候选基因及其潜在机制。方法：数据来源于NCBI的Gene Expression Omnibus数据库，下载编号为“GSE30122”、“GSE142153”的芯片数据。本研究使用R语言中GEO query包下载GEO芯片矩阵及临床信息，采用stringr、dplyr及limma等程序包对基因芯片数据进行质量分析。识别相关差异表达基因，然后对这些差异表达基因进行KEGG通路富集分析。结果：通过差异分析，共得到251个差异基因，其中上调基因174个，下调基因77个。结论：对差异基因进行KEGG富集分析，共得到37条KEGG通路富集结果，发病机制与Rheumatoid arthritis、Pertussis、NF-kappa B信号通路、Complement and coagulation cascades、Staphylococcus aureus infection信号通路等有关。糖尿病肾病发病是由多途径造成的，这也为临床医生提供了其潜在的治疗手段。
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