【摘 要】
:
针对程序性死亡蛋白-1 (programmed death-1,PD-1)的免疫疗法在乳腺癌中获得了显著成功.但是,并非所有患者都能从抗体治疗中受益.为了鉴定PD-1信号通路相关基因的表达及在乳腺癌中作为预后标志物的潜力,本文通过Oncomine、GTEx数据库和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库挖掘了PD-1信号通路相关基因的表达特征及预后作用,并且使用STRING数据库对其蛋白质-蛋白质相互作用网络进行了预测.结果 显示,PD-1信号通路相关基因的表达在不
【机 构】
:
岳阳职业技术学院慢性病重点实验室,中国湖南岳阳414000;湖南师范大学附属岳阳医院/岳阳市二人民医院,中国湖南岳阳414000;武汉科技大学生命科学与健康学院,中国湖北武汉430065
论文部分内容阅读
针对程序性死亡蛋白-1 (programmed death-1,PD-1)的免疫疗法在乳腺癌中获得了显著成功.但是,并非所有患者都能从抗体治疗中受益.为了鉴定PD-1信号通路相关基因的表达及在乳腺癌中作为预后标志物的潜力,本文通过Oncomine、GTEx数据库和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库挖掘了PD-1信号通路相关基因的表达特征及预后作用,并且使用STRING数据库对其蛋白质-蛋白质相互作用网络进行了预测.结果 显示,PD-1信号通路相关基因的表达在不同的癌症中表现出显著差异.在乳腺癌中,PD-1信号通路相关基因的表达水平显著高于正常组织,并且其表达情况与乳腺癌患者的分期及年龄无关.将乳腺癌患者按照PD-1和程序性死亡蛋白配体-1(programmed death ligand-1,PD-L1)表达的中位值分为高表达组与低表达组,高表达组显示出更好的总体生存率.此外,蛋白质-蛋白质相互作用网络预测结果显示,PD-1与非受体型蛋白质酪氨酸磷酸酶(protein tyrosine phosphatase non-receptor,PTPN)家族的表达高度相关.综上所述,本研究为开展新的基于PD-1的免疫疗法提供了理论支持.
其他文献
急性肺损伤是临床上常见的健康问题,具有较高的发病率和死亡率.识别疾病恶化的关键点及鉴定生物标志物对于有效的治疗至关重要,疾病的分子生物标志物一般依据分子表达水平的差异来获得,以区分疾病的正常状态和疾病状态,即只能用于疾病的诊断而不是预测.本文基于暴露在光气和空气中的小鼠急性肺损伤生物数据,采用单样本动态网络生物标志物的方法,构建了急性肺损伤的早期预警信号指标,以确定该疾病的临界点及相关的单样本特异性动态网络生物标志物.临界状态的基因功能分析和PPI网络分析表明:所获得的生物标志物与细胞衰老、凋亡、炎症反应
CBX(Chromobox)家族成员在不同肿瘤中的表达情况以及作用各异,在宫颈癌中的表达情况、临床意义和预后价值尚未清楚,有关个别成员的研究结果也存在争议.本研究通过ONCOMINE、GEPIA2、Human Protein Atlas、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter等数据库分析了CBX家族成员在宫颈癌中的临床意义和预后价值.在8个CBX家族成员中,与正常宫颈组织相比,CBX2/4/8在宫颈癌中的mRNA水平显著升高,而CBX6和CBX7的mRNA水平显著降低.CBX家族中各成员在
为探讨间充质干细胞发生成骨分化和成脂分化的潜在关联,本研究首先基于文献挖掘统计间充质干细胞成骨分化和成脂分化相关的差异表达基因,利用DAVID在线软件对差异表达基因进行功能注释和通路富集分析,得到成骨分化GO分类281种,KEGG通路13条(P<0.01);成脂分化GO分类317种,KEGG通路47条(P<0.01).随后,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将STRING数据库得到的网络数据导入Cytoscape软件进行分析,计算网络各节点的拓扑特性,筛选出成骨分化关键基因14个,成
为解决学生在生物化学课程学习中学习动力不足、学习效果差和学习效率低的问题,本课程教学团队将BOPPPS模式应用于课程混合式教学的设计中.本文分析了BOPPPS模式的内涵及其与混合式金课建设的关系,并以“核酸的理化性质及研究方法”一章为例,从准备、设计、实践和反馈改进四个阶段阐述基于BOPPPS的混合式教学设计,并探讨了提高教学质量的有效途径.
恶性肿瘤是威胁人类健康和导致死亡的主要原因之一.循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)从原发位肿瘤组织脱落是引起远处转移的重要原因,因此,CTCs的捕获和检测对癌症研究和临床治疗实践具有重要意义.而CTCs是“稀有细胞”,从复杂的血样中捕获及检测CTCs是当前急需解决的难题之一,纳米材料具有独特的结构和功能特性,已经广泛用于细胞捕获和细胞行为研究中,因此具备解决该挑战性问题的巨大潜力.在本综述中,主要讨论了纳米材料在CTCs捕获和检测中的应用,从而为肿瘤的监测和临床治疗实
该文研究并分析了PBL+翻转课堂用于生物化学和分子生物学实验教学的效果.传统组采用传统实验教学模式,观察组采用PBL+翻转课堂的实验教学模式.结果 显示,观察组学生在理论认知、实验论文书写、实验设计和文献分析等方面的能力提升优于传统组;观察组学生的实验总分也显著高于传统组学生;90%以上观察组学生认为实验内容很有趣,能够激发他们的研究热情,提高阅读和科研论文撰写能力.传统组学生对实验课的满意度低;87%的学生认为需要进行教学改革,提高学生的教学参与度.这些结果初步证实,PBL+翻转课堂教学模式能够激发学生
长期以来,花程式被广泛用于简要地描述被子植物各类群,特别是科的花形态、结构和各部分的数量.但是,植物学教材中,花程式存在诸多混乱,如:有的符号使用不规范;一些重要信息遗漏或错误;变态器官在少数科的花程式中加以记录,而在其他科被忽略.本文提出了一些建议,旨在改进和发展花程式教学.此外,本文还详述了一些方法,以帮助同学们解决植物学实验中遇到的一些有关花程式设计的困难.
生物化学是生物与医药等相关学科和专业的核心基础课程,知识结构复杂、信息量庞大且实践性很强,在教与学的过程中存在学时紧张、学习兴趣和主动性不高等问题,导致学生产生排斥和厌学情绪.OBE是一种以“成果产出”为导向的教育理念.在此理念指导下,在生物化学课程建设及教学中采用线上线下混合式教学模式,发现学生的主动性、自主学习能力和综合应用能力显著提高,整个生物化学课程教学质量也明显提升.
化学生物学课程是化学生物学专业的一门核心课程,是反映现代化学和生命科学交叉、融合的课程,为更好地使用多学科手段解决诸如人类健康等社会重大问题提供了新的思路.为了适应新形势下高等教育的发展要求,培养合格化学生物学专业人才,贵州医科大学化学生物学教研室的化学生物学课程教学团队在近几年教学实践的基础上对本课程进行了教学创新设计,构建了以智慧课堂为核心,充分利用雨课堂、学习通等信息化平台,将传统课程教学最大限度地延伸至课前及课后的创新型教学模式.该文从课程的创新理念、思路、方法、途径以及创新效果等方面进行了阐述和
生物化学代谢反应虽然涉及的分子式多、反应步骤繁杂,但很多代谢具有相似性.如果能发现代谢反应的共同点,总结其代谢规律,会对生物化学的学习起到很大的帮助作用.本文通过总结链式结构和环状结构分解代谢的特点、脱氢氧化不同类型的代谢规律、胆汁酸游离态和结合态存在的原因等案例,借助生活现象、生活图片进行比喻,将生物化学中抽象复杂的代谢简单化.采用类比推理方法对相似代谢进行分析,可有效提高课堂教学效果.本文旨在为同行的生物化学教学有所启示和帮助.