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蛋壳表面的的生物污染比较严重,其中有杆菌、球菌、芽孢菌、酵母菌和霉菌等,这些微生物有致病性的,也有非致病性的。据测定,刚产下的蛋,蛋壳上有100~300个细菌,产下15min后增加到5D0~600个,1h后达4660~5000个。这些微生物不但影响种蛋的孵化率、商品率,而且会污染孵化场,引起死胚或孵出弱、病雏,所以必须对种蛋进行消毒。