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系统功能语言学对科学实在论作过系统的论述，基于Whorf的语言相对论以及意义的建构论。该理论认为，语言形式-9意义之间具有对应关系，即“耦合”（coupling）。Halliday基于语法隐喻理论对科学语篇进行分析，指出科学知识并非对实在的符合，而不过是语言对人类经验的重建或重塑，科学理论只不过是语言的建构物。因此，Halliday都持科学的反实在论立场。Halliday的语言理论的科学实在观面临如下两方面的问题或困境：（1）无法划清科学理论与非科学或伪科学学说的界限；（2）无法对科学知识的增长或科学进步