论文部分内容阅读
目的
了解贵州省威宁彝族回族苗族自治县(以下简称威宁县)H9N2禽流感病毒的遗传变异情况,为禽流感病毒的防控提供依据。
方法随机选取2015至2017年贵州省威宁县城北活禽市场外环境实时PCR初筛H9N2禽流感病毒阳性标本13株,对13株H9N2禽流感病毒进行基因组的提取、神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对NA基因的同源性、遗传进化、颈部缺失位点、糖基化位点、受体结合关键位点和耐药位点变异情况进行分析。
结果13株H9N2禽流感病毒的NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为93.0%~100.0%和92.1%~100.0%,均属于DK/HK/Y280/97系,但遗传来源复杂多样。在NA蛋白颈部39~40位点有3株发生谷氨酰胺(Q)天冬酰胺(N)至Q赖氨酸(K)的突变,13株毒株在63~65位点均缺失苏氨酸(T)谷氨酸(E)异亮氨酸(I)3个氨基酸。13株毒株NA蛋白糖基化位点86、146、200和234较稳定,其余糖基化位点均存在数量和位点的变异。唾液酸结合位点的3个区域均有毒株发生突变,其中结合位点区域399~404变异最为活跃。NA蛋白酶活性位点和关键位点均未发生耐神经氨酸酶抑制剂药物的突变。
结论贵州省威宁县2015至2017年H9N2禽流感病毒属于DK/HK/Y280/97系,遗传来源复杂多样,NA基因颈部区域位点、糖基化位点和唾液酸受体结合位点发生了不同程度的变异,需进一步加强对H9N2禽流感病毒的持续监测与防控。