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心胸外科始建于20世纪80年代，是集科、教、研为一体的市级重点学科，已形成一支集心内、介入、儿科、心外、体外、麻醉、术后监护为一体的团结协作、乐于奉献、技术精湛的团队；建科以来共完成各类心血管外科手术千余例，各类普胸手术数千例，在本市乃至苏北地区享有很高的声誉。目前，科室人才梯队完备，拥有硕士生导师2名，副高以上职称医师5名，硕士研究生5名，在读博士和博士后各1名，完成多项省市级科研课题。2003年3月，与上海复旦大学中山医院合作，正式成立南通市心血管外科诊疗中心，2007年与上海交通大学附属上海儿童医学