基于生物信息学研究肝癌发生相关基因及其功能

来源 :中华肝脏外科手术学电子杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ztbai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 基于生物信息学探讨肝细胞癌(肝癌)发生相关基因及其功能.方法 从公共基因数据库GEO筛选并下载肝癌组织及癌旁组织基因芯片,通过GEO2R在线工具和Venn图网站筛选出差异表达基因(DEGs).对筛选出来的DEGs在DAVID网站进行基因本体(GO)功能分析和KEGG通路富集分析,再用STRING网站及Cytscape软件进行蛋白-蛋白相互作用网络分析并筛选出核心DEGs,最后将核心DEGs在Kaplan-Meier Plotter网站进行生存分析,筛选出与预后相关的DEGs.将与预后相关且在肝癌组织中高表达的DEGs经metascape网站进行GO功能及KEGG通路富集分析,分析与肝癌发生、发展相关的重要基因及其功能.结果 从3个基因芯片GSE60502、GSE14520、GSE45267共筛选出DEGs 124个.GO功能、KEGG通路富集分析、STRING网站及Cytscape软件分析后筛选出22个核心DEGs,11个基因与肝癌预后相关,其中9个基因在肝癌组织中高表达,包括GINS1、AURKA、NUSAP1、TOP2A、ASPM、RRM2、PRC1、RACGAP1、GMNN.metascape网站及KEGG通路富集分析发现,高表达基因涉及细胞核分裂过程、细胞周期中的有丝分裂、纺锤体组装、DNA构象改变.结论 基于生物信息学分析发现9个基因是肝细胞癌发生、发展的重要基因,参与细胞核分裂过程、细胞周期中的有丝分裂、纺锤体组装、DNA构象改变过程.
其他文献
随着全球经济的高速发展,世界能源消耗量也同步激增,致使目前能源供应呈现紧张局面。传统化石类能源不仅面临供应枯竭的危险,而且还存在高污染高碳排放的弊端。特别是我国是
近十年来,大规模突发事在世界各国频繁发生,如“9·11”事件、非典危机、印度洋海啸、汶川地震、日本311大地震等,这些事件不仅带来巨大损失,也给人们留下了永生难忘的惨痛回
什么内容是企业情报部门在情报的搜集与反搜集中,也就是在情报的“攻”“防”两个方面都必须高度关注的?笔者认为,这些内容是:在企业的竞争对手和目标对象内,那些未经大众媒
期刊
公司兼并与收购不仅是市场经济的产物。同时也是市场发展到一定阶段的必然要求。企业按照自身发展的需要,兼并和收购其他企业,是企业自身组织调整的重要方式,也是公司依据现
随着现代企业制度改革的深入和市场竞争的加剧,越来越多的企业认识到改善管理的重要性[1]。管理的首要问题是人的管理,而绩效考核恰恰是人的管理的一个核心内容。构建一套行