【摘 要】
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为了研究江苏地区鲫鱼养殖池塘底泥细菌菌群结构与多样性,通过高通量测序技术对2017年8~10月间采集的江苏省不同区域养殖池塘底泥中所有细菌的16SrRNAV3-V4基因进行扩增测定,
【机 构】
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中国药科大学生命科学与技术学院,南京市水产科学研究所
【基金项目】
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江苏省海洋与渔业局水产三新工程项目(Y2017-40)资助
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为了研究江苏地区鲫鱼养殖池塘底泥细菌菌群结构与多样性,通过高通量测序技术对2017年8~10月间采集的江苏省不同区域养殖池塘底泥中所有细菌的16SrRNAV3-V4基因进行扩增测定,分析了底泥菌群结构特征;并通过平板计数法和选择培养基法检测池塘底泥中细菌总数和主要常见菌。结果表明,49个样品高通量测序共获得有效序列2152956条,可归为17735个分类操作单元(OTUs);物种注释结果显示,鲫鱼养殖池塘底泥中具有较高的菌群多样性,检测到的细菌归属于29个门类;所有池塘底泥都具有主要门类为变形菌门、绿弯菌
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