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湖南衡东天光山自然保护区境内及周边共有野生种子植物152科640属1 316种(含种下单位),植物区系具有起源古老、地理成分复杂多样、国家重点保护野生植物种类丰富、中国特有成分多的特点;自然保护区不仅分布有大量的华东区系植物,而且还广泛分布有华中区系植物,这也使自然保护区种子植物区系具有典型的、浓厚的"华东—华中"过渡色彩,总体上自然保护区是属于华东植物区系。