【摘 要】
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目的 对一例新冠肺炎境外输入病例进行实验室检测，并对新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）变异株进行鉴定，了解不同样本类型中新冠病毒的检出情况。方法 采集咽拭子、痰液、粪便、尿液和血液多种类型样本共13份，分别提取核酸，用荧光RT-PCR法检测SARS-CoV-2。使用纳米孔Min ION Mk1C测序仪
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目的 对一例新冠肺炎境外输入病例进行实验室检测，并对新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）变异株进行鉴定，了解不同样本类型中新冠病毒的检出情况。方法 采集咽拭子、痰液、粪便、尿液和血液多种类型样本共13份，分别提取核酸，用荧光RT-PCR法检测SARS-CoV-2。使用纳米孔Min ION Mk1C测序仪，对阳性咽拭子样本进行实时SARS-CoV-2靶向扩增全基因组测序，运用artic-ncov2019、DNAstar和Mega等软件对测定序列进行处理和分析。结果 咽拭子、痰液、粪便、血浆和尿沉渣样本中均检出SARS-CoV-2核酸，咽拭子和血浆样本在发病的前四天均能检出，尿沉渣样本在发病当天能检出。基于纳米孔测序技术，7 h即获得SARS-CoV-2全基因组数据，经分析显示为新冠病毒Alpha变异株。结论 本例境外输入新冠肺炎确诊病例的病原为SARS-CoV-2 Alpha变异株，咽拭子、血浆样本和尿沉渣样本在发病早期均能检出SARS-CoV-2核酸。
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