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学科文化对学科的发展有重要影响，各学科由于学科文化所形成的藩篱对跨学科研究的发展有负面影响。学科文化由学科知识文化（包括学科的知识体系、价值体系等）和学科组织文化（包括学科文化的主体、场域和规范体系等）组成，是一门学科区别于另一门学科的重要依据，具有学术性、相对封闭性和相对稳定性的特征。学科文化真正融入跨学科研究通常要经历蜜月期、敌意期（偏见期）、恢复期和适应期4个阶段。“永恒性的跨学科结构”的形成需要一种与跨学科研究特征相匹配的学科文化。跨学科研究中学科文化的融合需要互通性的学科知识、支持鼓励多学科融合