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采用ISSR分子标记技术对云南省3个大果木莲天然居群进行遗传多样性分析。结果表明,在物种水平上,大果木莲的多态位点百分率（PPB）为70.71%;有效等位基因数（Ne）为1.4121;Nei′s基因多样性指数（H）为0.2433;Shannon信息指数（I）为0.3651。在居群水平上,其PPB为44.1%;Ne为1.2704;H为0.1573;I为0.2343。通过Nei′s遗传多样性分析得到居群间的遗传分化系数（Gst）为0.3595,由遗传一致度进行了3个居群的UPGMA聚类。