P基因片段测序分析HBV基因分型及耐药位点

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目的

建立一种高效、准确的HBV基因分型及核苷类药物相关耐药突变位点分析的新方法。

方法

2011年7至8月在太原市第三人民医院收集48份乙型肝炎患者血清标本,利用商品化核酸提取试剂盒提取标本DNA,然后分别进行HBV全基因组和P基因片段扩增,最后对产物进行测序分析,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法进行基因分型,并对两种扩增产物的分型结果进行比较。

结果

共得到48条HBV全基因组序列,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法确定12条B型序列和36条C型序列;对HBV P基因片段测序产生的序列进行分型,结果与全基因组测序分析完全一致。通过对HBV P基因序列进行分析,共发现7种核苷类药物耐药突变形式,所测标本突变比例达27.1%(13/48),其中所有突变均与拉米夫定或阿德福韦酯相关,未检测到其他核苷类药物相关耐药突变位点。另外,利用荧光定量PCR法对同样48份标本进行分型检测,共得出B型11例,C型35例,BC混合型2例。

结论

乙型肝炎病毒P基因片段测序可能是一种新型乙型肝炎病毒分型方法。同时,该方法还可对核苷类药物相关耐药突变进行分析,为乙型肝炎临床治疗提供依据。(中华检验医学杂志,2012,35:726-729)

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