【摘 要】
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目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA
【机 构】
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浙江省农业科学院农产品质量标准研究所,西北农林科技大学食品科学与工程学院
【基金项目】
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浙江省公益技术运用研究项目(2016C32073),浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地项目(2010DS700124-ZM1608)
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目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行聚合酶链式反应扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果:两种方法采集的样品在细菌基因组DNA提取、菌群丰富度、多样性及菌群结构等方面均无显著差异(P〉0.05)。高通量测序结果表明,冷鲜鸡表面细菌菌群主要分布于7个门,10个属。
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