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潜伏侵染是病原菌侵入到寄主组织后不马上发病，而要等到寄主或环境条件适宜才表现症状的一种侵染现象，生物鉴定法、组织学法和血清学法可用于确定某一病害是否存在潜伏侵染。已知果树和农作物病害存在潜伏侵染现象的主要有香蕉炭疽病（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｉｄｅｓ）、西红柿腐烂病（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ａｌｔｅｒｎａｔａ）、羽扇豆茎腐病（Ｐｈｏｍｏｐｓｉｓ ｌｅｐｔｏｓｔｒｏｍｉ－f