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蛋白质组学研究是一项系统性的科学探索，蛋白质组学分析仪器是生命科学领域的重要技术支撑。本文分析了目前国内高校蛋白质组学分析仪器用于本科实验教学的现状及存在的主要问题，结合吉林大学国家级生物实验教学中心的教学实践，介绍了双向凝胶电泳、红外激光成像、飞行时间质谱和X-射线单晶衍射仪等蛋白质组学相关仪器在本科实验教学中的应用，激发了学生实验创新意识，提高了优质资源的共享效率。